泡沫通常是由气液接触而产生，一般在纯溶剂的液体中由通气而导致起泡的持续时间很短，所以不需要外加消泡手段。但当溶剂中有一种或一种以上的表面活性剂存在，泡沫的持续时间就会较长。生物发酵很多情况下都是好氧发酵，所以通气是必不可少的环节，因为发酵培养基本身就含有许多表面活性物质，比如表面活性蛋白类、油类(磷酸盐、脂肪胺盐等)、脂肪酸、酯类、聚二乙醇和硅氧烷、醇类、亚硫酸盐和磺酸盐等。再加上发酵过程中菌种又会产生一些表面活性物质，从而导致生物发酵的泡沫相当多。虽然气泡在溶液中的活动可以增加溶液的溶氧，为菌体提供足够的氧气，但是这些气泡浮出液面后会因表面活性剂的作用而难以自身破灭，积聚增多后就会导致包括上述问题在内的多种危害，所以需增加额外的消泡手段来维持发酵过程的正常进行，比如添加化学消泡剂或安装机械消泡器等。